科技日报讯(记者 马爱平)记者12月17日从中国农业大学动物科学时代学院获悉,该院汲引方好意思英团队在海外期刊《当然·遗传》发表最新遵循,发布了世界首个公猪T2T(端粒到端粒)完整基因组(T2T-pig1.0)。该究诘为猪基因组究诘提供了要津基础数据,对猪品种改变具有垂危教授真义,同期拓展了猪四肢生物医学究诘形式动物的诳骗出路。
家猪自约1万年前被驯化以来,已成为世界垂危的农用动物和生物医学究诘形式动物。然则,受测序时代截至,猪参考基因组在重叠序列富集区域仍存在数百个缺口尚未领路,如着丝粒和Y染色体异染色质区。此外,由于短缺高质地、完整的家猪基因组资源,其基因组进化机制及决定其私有性状的要津突变究诘仍短缺垂危基因组资源撑执。
该究诘以中国五指山袖珍猪为模子,初度完成了公猪端粒到端粒无弊端基因组拼装,其中包含完整的Y染色体和着丝粒区域。论文共同通信作家方好意思英告诉记者,该究诘构建了一个包括26.3亿个碱基对、质地值达到51.41的好意思满口T2T基因组。与现存参考基因组比拟,该基因组新增领路区域1亿9442万个碱基对,其中包含1189个基因。基于基因组分析,该究诘发现了亚洲猪基因组的3种主要祖源因素,并证据东北亚猪种存在欧洲猪遗传因素,愈加精确地揭示了家猪群体的遗传结构及亚洲猪群间的基因浸透关系。
“此外,本究诘在中国五指山袖珍猪基因组中发现了133个受到热烈汲取的新基因,它们可能与其小体型性状关联。究诘还初度领路了多肽N-乙酰氨基半乳糖转换酶13基因调控体型性状的机制,为小体型猪培育提供了基因素材。”方好意思英说。